miscellaneous

Miscellaneous links to be organised. Ordan burdan derlenmiş ama düzenlenmemiş güncel patoloji içerikleri. https://www.parapathology.com/appendix/miscellaneous

Annotating for Artificial Intelligence Applications in Digital Pathology: A Practical Guide for Pathologists and Researchers

When reading slides this is the nightmare of the pathologist.

Multimodal histopathologic models stratify hormone receptor-positive early breast cancer https://www.nature.com/articles/s41467-025-57283-x

Adam daha retikülini oturtamamış, bana PD-L1 için app kullanın daha rahat cut-off tespit edersiniz diyor.

2 Mart 2025. Sosyal medyada paylaşılanlara göre PubMed erişiminde aksaklıklar yaşanıyormuş. Eskiden hemen her Amerikan fedeal bütçesinin askıda kaldığı dönemde güncellemelere ara verilirdi. Ama bu derecede erişim sıkıntısını hiç görmemiştim. Yıllar önce PubMed abstract'larını sistematik bir şekilde -yine PubMed'in sağladığı entrez araçlarıyla- indirip kaydetmiştim. O dönemlerde daha Large Language Modeller yoktu ama "write your own book" kodlu projeler üzerinde çalışıyorduk. https://github.com/sbalci/bibliometrics Sonra işte olanlar oldu, ölenler öldü. Projeler ve hayaller akim kaldı. Halbuki bugün bir PubMed mirror'u yapabilmemiz mümkündü. Bir tür "içimde kalanlar" ya da "ukdeler CV"si hazırlayayım bari ...

2 Mart 2025. Olayın kök nedenine bakmak lazım. Bu adamlar ne "mal sahibi" ne de "işi yapan" kişiler. Bir dönem işin erbabı olan, ama zaman içinde yeniliklere ayak uyduramadığı için artık o işi yapamayanlar, tecrübelerinden istifade edilmek üzere bir tür "ara müdür" olarak hayatlarını sürdürebilirler. Peter principle da değil, onlar da başka, bunlar da başka. Bunlar "profesyonel yönetici" olduklarını iddia eden, ne işin mutfağında çalışmış ne de malın sahibi olmayan, bugün bir şirkette başka bir gün başka bir şirkette yer alabilecek, "plaza dili" ile tekellüm eden, C-Level olarak kendilerini tanımlayanlar. Ara müdürlerin en işe yaramaz olanları. İşi bilmedikleri için, o işin mutfağı ile uğraşamazlar. Boş görünmemek için de kendilerine meşgale icat ederler. Kurumsal mesaj yayınlamak ya da yayımlamamak ya da yayımlayanlara had bildirmek ya da o kurumsal mesajda kullanılan rengin fontunu belirlemek gibi. Bunların en "prestijli" olanlarını 8 Mart'ta yayınlayacakları mesajlarda görürsünüz. Kadın çalışanlarına gebelik ve süt izni vermez, "bu bekar yakında evlenir gider" diye iş vermez, kadınlara daha ucuz maaş verir, ama 8 Mart'ta ünlü birkaç kişi ile poz ve mesaj verirler. Yani olayın özüyle bu ayın bir ilgisi yok. Zaten bu ayda sevinebilmek biraz da nasip işi, o apayrı bir şey. Heman Mevlam cümlemize selamet versin, mal ve iş sahiplerini bu C-level'ların şerrinden halas eylesin.

The tumour histopathology “glossary” for AI developers https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1012708

Biyopsi bakarken ben:

Reproducibility of endometrial intraepithelial neoplasia diagnosis is good, but influenced by the diagnostic style of pathologists https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22301705/

An international study of stain variability in histopathology using qualitative and quantitative analysis https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2153353925000057

Comparative performance of PD-L1 scoring by pathologists and AI algorithms https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/his.15432

Artificial intelligence in digital pathology — time for a reality check

https://github.com/microsoft/data-formulator

A new vision in Pathology: From clinical implementation of Digital Pathology to algorithm development in Computational Pathology https://repositorio-aberto.up.pt/handle/10216/165284

Digital Pathology in Endocrine Disorders https://link.springer.com/collections/gabfeibadh

A multicenter study to evaluate the analytical precision by pathologists using the Aperio GT 450 DX https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11600015/

An international study of stain variability in histopathology using qualitative and quantitative analysis https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2153353925000057#s0040

Tissue Image Analytics (TIA) Centre https://warwick.ac.uk/fac/cross_fac/tia/seminars/seminars-24-25/

When Doctors With A.I. Are Outperformed by A.I. Alone https://erictopol.substack.com/p/when-doctors-with-ai-are-outperformed

Bu federasyonun yeni çalışması https://turkpath.org.tr/files/pdf/rehber.pdf PBYS için önerilen özelliklere bakın. bu ise benim notlarımın bulunduğu sayfa https://www.parapathology.com/laboratory-management/laboratory-information-systems/patoloji-moduelue-oezellikleri zamanında ben bu şartnameyi hazırlamıştım. 2011 olmalı. O sırada kalite komisyonundaydım. Bir örneğini vermiştim komisyona. Çok da bir ilerleme kaydedememişler görünen o ki. Bari referans verselerdi.

PreviousClippings NextPathology and Social Media

Last updated 1 month ago

Was this helpful?