P Value

p value

• Big names in statistics want to shake up much-maligned P value

http://www.nature.com/news/big-names-in-statistics-want-to-shake-up-much-maligned-p-value-1.22375

• Redefine Statistical Significance Part I: Sleep Trolls & Red Herrings

https://www.bayesianspectacles.org/redefine-statistical-significance-part-i-sleep-trolls-red-herrings/

• Redefine Statistical Significance Part II: Caught in a Bad Romance?

https://www.bayesianspectacles.org/redefine-statistical-significance-part-ii-caught-in-a-bad-romance/

• Redefine Statistical Significance Part III: Informed Priors and Oracle Priors

https://www.bayesianspectacles.org/redefine-statistical-significance-part-iii-informed-priors-and-oracle-priors/

• The “80% power” lie

http://andrewgelman.com/2017/12/04/80-power-lie/

• "Şuna bir p değeri attırıversen" diyeni duymuştum da bunu ilk kez duyuyorum:

https://www.linkedin.com/feed/update/urnactivity:6381174203160293377

p < 0.05 sizin için ne anlam ifade ediyor?

Güncelleme 1: “P-hacking” nedir? Bilimsel literatürde yarattığı sorunlar nelerdir? 
https://lnkd.in/eEKbjSj

Güncelleme 2: Bilimsel çalışmaların kalitelerinin, kanıt düzeylerinin arttırılması ve bilimsel çalışmalardaki “tekrarlanabilirlik” sorununun çözülmesi için yapılması gerekenlerin sıralandığı güzel bir çalışma. 
https://lnkd.in/eHJydDB

Güncelleme 3: İstatistiksel anlamlılığın p<0.05 yerine p<0.005 olması gerektiğini belirten bir çalışma 2017 yılında yayınlandı. https://lnkd.in/eC7MNDw
Aynı yıl bunun “bilimdeki tekrarlanabilirlik” problemine çare olmak yerine hali hazırdaki durumu daha kötüye götüreceğine ilişkin bir çalışma yayınlandı. https://lnkd.in/eJk6RbJ

Güncelleme 4: 2015 yılında Basic and Applied Social Psychology  dergisi yayınlarında p değeri kullanan makaleleri yayınlamama kararı aldı. https://lnkd.in/ew4eNRG

Görüldüğü gibi p değerinin kullanımı ve kullanım şekli bilimsel literatürde hala sıcak bir tartışma konusu. Bu nedenle, (her konuda olduğu gibi) güncel bilimsel literatür dikkatle takip edilmeli. Bilimde herşeye şüpheyle yaklaşılması gerektiği gibi bu konuya da şüpheyle yaklaşılmalı ve istatistikte her zaman yapılması gerektiği gibi p değeri de dikkatli kullanılmalı ve yorumlanmalıdır.

http://www.nicebread.de/

http://www.nicebread.de/

https://www.shinyapps.org/apps/vs-mpr/

• Raise the bar rather than retire significance

https://www.nature.com/articles/d41586-019-00970-9

• How sure are you of your result? Put a number on it

  Any scientist publishing a claim should quantify their confidence in it with a probability, argues Steven N. Goodman.

  https://www.nature.com/articles/d41586-018-07589-2

Adjust P-values for Multiple Comparisons

R: Adjust P-values for Multiple Comparisonsstat.ethz.ch

q value

Bioconductor’s qvalue package

StoreyLab/qvalue

GitHub - StoreyLab/qvalue: R package to estimate q-values and false discovery rate quantities.GitHub