Digital Pathology

Digital Pathology & AI in routine clinical practice:From quality control to primary cancer diagnosis

Argenit

X-WOW

QuPath

Mac OS için.svsdosyalarını açacak program ararken bulmuştum QuPath'ı.
QuPath'ın validasyonu kolon tümörlerinde CD3, CD8, p53 ve PD-L1 skorlaması yanısıra H&E preparatlarındaki tümör-stroma oranı ile yapılmış. Örnekler TMA üzerinde, kod ile ve otomatik analiz ile skorlanmış. Önemli bir nokta skorlamalar sağ kalım ile de karşılaştırılmış.
QuPath'ın oldukça iyi eğitim dökümanları var:
Makaledeki videolar şunlar:
Makalenin referans verdiği diğer dijital analiz araçlarının makaleleri ise şunlar:
  • Websites
Cancer Digital Slide Archive: an informatics resource to support integrated in silico analysis of TCGA pathology data
  • Johns Hopkins Pathology Unknowns
  • Softwares
  • Easy Scanner
  • Smartphone Whole Slide Imaging(sWSI) Demo--Low Cost Slide Scanner.
  • Google's interest in digital pathology is very important for our field. See 55th minute
  • Detecting Cancer Metastases on Gigapixel Pathology Images
  • Manual Microscope Image Stitching
  • Motic EASY SCAN PRO Pathology Slide Scanner
  • Metadata matters: access to image data in the real world
  • Detecting cancer in real-time with machine learning
  • Whole Slide Imaging Versus Microscopy for Primary Diagnosis in Surgical Pathology: A Multicenter Blinded Randomized Noninferiority Study of 1992 Cases (Pivotal Study).
  • The Gold Standard Paradox in Digital Image Analysis Manual Versus Automated Scoring as Ground Truth
Arch Pathol Lab Med. 2017 May 30. PMID: 28557614 DOI: 10.5858/arpa.2016-0386-RA

About the Usage of Digital Pathology

  • Whole Slide Imaging Versus Microscopy for Primary Diagnosis in Surgical Pathology: A Multicenter Blinded Randomized Noninferiority Study of 1992 Cases (Pivotal Study).
  • The Gold Standard Paradox in Digital Image Analysis Manual Versus Automated Scoring as Ground Truth
Arch Pathol Lab Med. 2017 May 30. PMID: 28557614 DOI: 10.5858/arpa.2016-0386-RA
  • Whole Slide Imaging Versus Microscopy for Primary Diagnosis in Surgical Pathology: A Multicenter Blinded Randomized Noninferiority Study of 1992 Cases (Pivotal Study).
  • The Gold Standard Paradox in Digital Image Analysis Manual Versus Automated Scoring as Ground Truth
Arch Pathol Lab Med. 2017 May 30. PMID: 28557614 DOI: 10.5858/arpa.2016-0386-RA
  • Whole Slide Imaging Versus Microscopy for Primary Diagnosis in Surgical Pathology: A Multicenter Blinded Randomized Noninferiority Study of 1992 Cases (Pivotal Study).
  • The Gold Standard Paradox in Digital Image Analysis Manual Versus Automated Scoring as Ground Truth
Arch Pathol Lab Med. 2017 May 30. PMID: 28557614 DOI: 10.5858/arpa.2016-0386-RA

Digital Pathology

Mac OS için.svsdosyalarını açacak program ararken bulmuştum QuPath'ı.
QuPath'ın validasyonu kolon tümörlerinde CD3, CD8, p53 ve PD-L1 skorlaması yanısıra H&E preparatlarındaki tümör-stroma oranı ile yapılmış. Örnekler TMA üzerinde, kod ile ve otomatik analiz ile skorlanmış. Önemli bir nokta skorlamalar sağ kalım ile de karşılaştırılmış.
QuPath'ın oldukça iyi eğitim dökümanları var:
Makaledeki videolar şunlar:
Makalenin referans verdiği diğer dijital analiz araçlarının makaleleri ise şunlar:
  • Websites
Cancer Digital Slide Archive: an informatics resource to support integrated in silico analysis of TCGA pathology data
  • Johns Hopkins Pathology Unknowns
  • Softwares
  • Easy Scanner
  • Smartphone Whole Slide Imaging(sWSI) Demo--Low Cost Slide Scanner.
  • Google's interest in digital pathology is very important for our field. See 55th minute
  • Detecting Cancer Metastases on Gigapixel Pathology Images
  • Manual Microscope Image Stitching
  • Motic EASY SCAN PRO Pathology Slide Scanner
  • Metadata matters: access to image data in the real world
  • Detecting cancer in real-time with machine learning
Mac OS için.svsdosyalarını açacak program ararken bulmuştum QuPath'ı.
QuPath'ın validasyonu kolon tümörlerinde CD3, CD8, p53 ve PD-L1 skorlaması yanısıra H&E preparatlarındaki tümör-stroma oranı ile yapılmış. Örnekler TMA üzerinde, kod ile ve otomatik analiz ile skorlanmış. Önemli bir nokta skorlamalar sağ kalım ile de karşılaştırılmış.
QuPath'ın oldukça iyi eğitim dökümanları var:
Makaledeki videolar şunlar:
Makalenin referans verdiği diğer dijital analiz araçlarının makaleleri ise şunlar:
  • Websites
Cancer Digital Slide Archive: an informatics resource to support integrated in silico analysis of TCGA pathology data
  • Johns Hopkins Pathology Unknowns
  • Softwares
  • Easy Scanner
  • Smartphone Whole Slide Imaging(sWSI) Demo--Low Cost Slide Scanner.
  • Google's interest in digital pathology is very important for our field. See 55th minute
  • Detecting Cancer Metastases on Gigapixel Pathology Images
  • Manual Microscope Image Stitching
  • Motic EASY SCAN PRO Pathology Slide Scanner
  • Metadata matters: access to image data in the real world
  • Detecting cancer in real-time with machine learning
  • Single slide scanner
optiscan